从“专家装置”到平台共享设备:一台 RIM 超分辨显微镜如何在成像平台落地

2026_10-26

全文约 1,971 字,阅读约需 5 分钟

文献来源(INSCOPER 文献库标注:Super-Resolution (DRIM))

Soler, N., Le Marchand, G., Dutertre, S. et al. Implementation and Optimization of a Random Illumination Microscope: towards Robustness for Microscopy Core Facility. Biology of the Cell 118, e70060 (2026).

DOI:https://doi.org/10.1111/boc.70060

原文以 Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 许可开放获取。本文为文字解读,未嵌入原文插图;配图请读者参阅原文 DOI。


导语

一种超分辨技术能否真正被大量生物学用户用起来,往往不取决于它在原创实验室里能做到多好,而取决于它能否在成像平台(core facility,向全所或全校开放的公共显微镜实验室)里稳定运行、被非专业用户独立操作。法国雷恩 MRic 成像平台联合 IGDR 与图卢兹 CBI 团队在 Biology of the Cell 发表的这篇技术论文,完整记录了他们搭建、校准和优化一台随机照明显微术(Random Illumination Microscopy, RIM)原型机的过程,并与 Airyscan、SRRF 等方法做了对比。对于正在评估 RIM / liveDRIM 的平台管理者,这篇文章的参考价值在于“落地细节”。


系统构成:三部分,一套同步逻辑

RIM 是一种宽场荧光显微技术:用空间光调制器(spatial light modulator, SLM,可按程序改变光波前的液晶微显示器)在样品上产生随机散斑照明,采集一组图像后,通过统计方差重建超分辨图像。

论文描述的系统包括:

  1. 光学模块:405/488/561/642 nm 四线激光;Forth Dimension QXGA-R11 型 SLM(2048 × 1536 像素),板载内存预存 400 幅随机噪声图像,每组采集(通常 100–200 张)循环调用;整个模块用笼式结构固定以保证稳定。

  2. 显微镜:Nikon Ti2,主要使用 100× 硅油物镜(NA 1.35),Hamamatsu ORCA-Fusion sCMOS 相机,压电 Z 台。

  3. 控制系统:Inscoper 控制盒与软件(版本 8.5.18)负责 XYZ、物镜、滤光片、激光和相机控制;相机、SLM、激光和控制盒之间通过硬件触发信号同步——控制盒触发相机曝光并同时开启激光,相机在曝光开始时通知 SLM 切换散斑。

SLM 采用“1-bit 平衡序列”显示模式:每幅噪声图先显示正帧,再显示等时长的负帧以保护液晶,单帧时长可选 2、4 或 10 ms。作者把相机的触发模式、各器件之间的信号时序都画成了时序图,便于其他平台复现。


校准与优化:把“经验”写成流程

1. 对准检查。 作者在 SLM 上投影棋盘格图案代替随机噪声,用线条锐利度判断光路是否对准;再对散斑图像做快速傅里叶变换(FFT),从频谱曲线读取散斑对比度与散斑大小。刻意失调实验显示:透镜位置偏移(40 cm 焦距偏 10 cm)影响较小,半波片旋转 1/8 圈影响更明显,两者叠加时影响累积。

2. 有效视场(RimZone)。 受 SLM 面积限制,散斑只覆盖相机的一部分,有效区域约 33.28 × 33.28 µm,且照明呈激光的高斯分布、不均匀。作者建议可用均匀荧光片的图像做校正。

3. “闪烁”与漂白的平衡。 采集时样品应明显“闪烁”(sparkling),反映散斑照明有效;闪烁不足时 FFT 高频成分下降。提高激光功率或曝光时间能改善闪烁,但会加重光漂白;降低功率会损失对比度,但仍能得到可用的重建。

4. 重建参数。 使用开源 AlgoRIM 重建,需要优化两个参数:预滤波参数 w(Wiener 滤波)和正则化参数 r。作者给出“先对数步长粗找、再二分细找”的流程,以 0.1 µm 荧光微球为例得到 w = 0.01、r = 0.1。作者强调:每个样品、每次采集条件改变,都需要重新优化参数。


性能与应用对比

作者用 Argolight Argo-HM 标定片评估分辨率:RIM 可分开间距 150 nm 的线对,且对比度明显优于宽场(散斑图像均值)。据此估计系统横向分辨率在 100–150 nm 之间。需要说明,实验直接证明的是“150 nm 线对可分辨”,100 nm 下限是作者的估计区间。

在成年秀丽隐杆线虫(C. elegans)肠道刷状缘微绒毛(ERM-1/ezrin-mNeonGreen)样品上,RIM 复现了此前用 Airyscan 和图卢兹原始 RIM 原型观察到的约 150 nm 周期排列;作者描述 RIM 图像中单根微绒毛对比度更好,单幅采集约 2 s,而 Airyscan 约 1 分 20 秒。

在 HK2 细胞有丝分裂纺锤体(微管标记)的三维成像中差距更明显:Airyscan 采集 10 个 z 层用时约 7 分钟,RIM 采集 24 个 z 层用时约 48 秒。此外,作者在线粒体样品上将 RIM 与超分辨径向涨落(Super-Resolution Radial Fluctuations, SRRF)比较,认为 RIM 显示了更多线粒体亚结构细节,但也指出这些结构需要专门研究进一步验证。

论文表 1 汇总了作者平台上的比较:SP8 共聚焦 180–250 nm、单幅约 5 min;Airyscan 140 nm、42 s–1 min 20 s;SRRF 60–120 nm、45 s 采集加 2 min 重建;RIM 100–150 nm、2 s 采集加 1 s 重建,漂白程度最低。

在可用性方面,平台编写了用户手册和标准化培训流程,使生物学用户可以在没有工程师协助的情况下独立使用该系统;但用户仍需根据自己的问题调整散斑数量、SLM 曝光时间和多维采集方式,并自行完成重建参数的选择。


局限与需要注意的地方

  1. 这是原型机论文,不是商业系统评测。 所有数据来自雷恩平台自建原型,性能与商业产品不能直接等同。

  2. 对比条件不完全一致。 Airyscan、SRRF、共聚焦的采集参数由作者设定,不同仪器的“单幅采集时间”取决于视场、层数和设置;SRRF 在表 1 中的标称分辨率(60–120 nm)甚至高于 RIM,而作者的“RIM 细节更多”来自图像观察,并无定量分析。

  3. 作者自述的不足:参数需按样品调优,上手有门槛;有效视场照明不均匀,暂不适合定量荧光强度测量;扩束器未完全覆盖 SLM;当前分辨率(100–150 nm)尚未达到图卢兹 LITC 平台约 100 nm 的水平。

  4. 利益冲突:论文声明,作者之一(M. T.)为 Inscoper 联合创始人和科学顾问,S. L. 与 T. M. 为 Rimeo 联合创始人。


与 liveDRIM 的关联

  • 本文使用的是平台自建 RIM 原型,而非商业化 liveDRIM 整机;其中控制与同步部分采用 Inscoper 控制盒和软件,SLM 为 Forth Dimension QXGA 系列,重建使用 AlgoRIM——这些与 liveDRIM 的技术组成同源。

  • 论文作者包括 Inscoper 和 Rimeo 的联合创始人,阅读结论时应考虑这一背景;INSCOPER 官方文献库将本文归入“Super-Resolution (DRIM)”类别。

  • 对平台用户的启发:文章坦率记录了 RIM 落地时需要关注的环节——光路对准监控、散斑质量判断、闪烁与漂白平衡、重建参数优化以及用户培训手册。这些也是评估商业化 liveDRIM 时值得向厂商询问的问题:系统是否内置对准/散斑质控、参数是否有预设、视场照明均匀性如何、培训与手册是否完善。


原文信息

  • 题名:Implementation and Optimization of a Random Illumination Microscope: towards Robustness for Microscopy Core Facility

  • 作者:Nina Soler, Gilles Le Marchand, Stéphanie Dutertre, Xavier Pinson, …, Simon Labouesse, Thomas Mangeat 等

  • 期刊:Biology of the Cell 118, e70060(2026)

  • DOI:https://doi.org/10.1111/boc.70060

  • 开放获取全文:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12968945/

  • 许可:CC BY-NC-ND 4.0

本文为对原文的解读,非作者官方译文。


中国区合作伙伴

北京欧浩科技有限公司(Oriental Horizon Technology)为 INSCOPER / liveDRIM 中国区合作伙伴。

咨询:张女士,judy.cheung@ohhktech.com,13511029964

产品试用的申请